Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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Traf3ip1Q149C2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Traf3ip1Q149C2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Traf3ip1Q149C2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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