Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpne7Q0VE82 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms