Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
StumQ0VBF8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
StumQ0VBF8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms