Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pglyrp4Q0VB07 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms