Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vps8Q0P5W1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vps8Q0P5W1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms