Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttc21bQ0HA38 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
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Ttc21bQ0HA38 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Ttc21bQ0HA38 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Ttc21bQ0HA38 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Ttc21bQ0HA38 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Ttc21bQ0HA38 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Ttc21bQ0HA38 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Ttc21bQ0HA38 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Ttc21bQ0HA38 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttc21bQ0HA38 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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