Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf541Q0GGX2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf541Q0GGX2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms