Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Pate4Q09098 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms