Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxc4Q08624 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxc4Q08624 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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