Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Calb2Q08331 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Calb2Q08331 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms