Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cnn2Q08093 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cnn2Q08093 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms