Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NrepQ07475 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
NrepQ07475 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NrepQ07475 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms