Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cntn3Q07409 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms