Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PtprgQ05909 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms