Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a1Q04857 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a1Q04857 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a1Q04857 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a1Q04857 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a1Q04857 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Col6a1Q04857 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a1Q04857 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a1Q04857 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a1Q04857 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a1Q04857 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a1Q04857 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a1Q04857 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a1Q04857 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Col6a1Q04857 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Col6a1Q04857 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms