Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1Q04750 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Top1Q04750 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Top1Q04750 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms