Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Emx2Q04744 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Emx2Q04744 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms