Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RelaQ04207 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RelaQ04207 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RelaQ04207 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms