Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnb1Q03717 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms