Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scg2Q03517 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Scg2Q03517 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms