Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tff2Q03404 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tff2Q03404 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms