Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1sQ02789 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms