Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gjb5Q02739 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms