Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gjb4Q02738 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms