Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GscQ02591 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GscQ02591 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GscQ02591 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GscQ02591 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GscQ02591 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GscQ02591 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GscQ02591 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GscQ02591 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GscQ02591 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GscQ02591 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GscQ02591 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GscQ02591 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GscQ02591 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GscQ02591 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GscQ02591 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GscQ02591 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GscQ02591 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GscQ02591 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GscQ02591 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GscQ02591 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GscQ02591 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GscQ02591 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GscQ02591 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GscQ02591 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GscQ02591 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GscQ02591 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GscQ02591 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms