Protein–RNA interactions for Protein: Q02357

Ank1, Ankyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ank1Q02357 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ank1Q02357 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ank1Q02357 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms