Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cacna1cQ01815 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms