Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Top2aQ01320 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Top2aQ01320 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms