Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gja5Q01231 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gja5Q01231 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms