Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Grin2cQ01098 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms