Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IhhP97812 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IhhP97812 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IhhP97812 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IhhP97812 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IhhP97812 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IhhP97812 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IhhP97812 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IhhP97812 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IhhP97812 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IhhP97812 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IhhP97812 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IhhP97812 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
IhhP97812 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IhhP97812 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IhhP97812 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IhhP97812 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
IhhP97812 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IhhP97812 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IhhP97812 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IhhP97812 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IhhP97812 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IhhP97812 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IhhP97812 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IhhP97812 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IhhP97812 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IhhP97812 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms