Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lig3P97386 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms