Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trim43bP86448 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trim43bP86448 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trim43bP86448 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trim43bP86448 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Trim43bP86448 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Trim43bP86448 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim43bP86448 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms