Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Arf1P84078 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Arf1P84078 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Arf1P84078 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Arf1P84078 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arf1P84078 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arf1P84078 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arf1P84078 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms