Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ldb1P70662 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ldb1P70662 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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