Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tp53bp1P70399 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms