Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxb13P70321 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms