Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sycp3P70281 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sycp3P70281 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sycp3P70281 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sycp3P70281 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sycp3P70281 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sycp3P70281 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sycp3P70281 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sycp3P70281 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sycp3P70281 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sycp3P70281 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sycp3P70281 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Sycp3P70281 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sycp3P70281 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Sycp3P70281 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sycp3P70281 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sycp3P70281 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sycp3P70281 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp3P70281 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp3P70281 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp3P70281 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp3P70281 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp3P70281 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp3P70281 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp3P70281 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sycp3P70281 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms