Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SbdsP70122 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms