Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrkcbP68404 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms