Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4bP68372 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms