Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Acta1P68134 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms