Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vamp3P63024 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms