Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl3P58873 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms