Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tpm2P58774 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm2P58774 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms