Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
P58686 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
P58686 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
P58686 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms