Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp25P57080 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp25P57080 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp25P57080 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp25P57080 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp25P57080 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp25P57080 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp25P57080 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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