Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Bace1P56818 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Bace1P56818 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms