Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sh3bp1P55194 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms