Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NrlP54846 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NrlP54846 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NrlP54846 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms